El actual estado de Oaxaca está situado en la porción meridional de la República Mexicana, limita al norte y noreste con Veracruz y Puebla, al este con Chiapas, al sur con el océano Pacífico y al oeste con Guerrero. A su vez se divide en ocho regiones que abarcan 570 municipios en una extensión total de 91 783 km2 y representa el 4.78% del territorio nacional (INEGI 2019). Dentro de Oaxaca existe una miríada de grupos humanos que han habitado este territorio desde hace varios siglos. Prueba de ello es que dicha entidad registra el mayor número de hablantes de lengua indígena, con más de un millón de personas, lo que, en términos estadísticos, es el 39.1% de su población y el 19.3% del total de hablantes de lengua indígena del país (INEGI 2005). De este número, destacan el mixteco y el zapoteco como las lenguas más habladas del estado, sus hablantes se relacionan con el devenir histórico de Oaxaca, desde el periodo Prehispánico y hasta el presente, por lo que su estudio, desde el punto de vista genético, es de primordial importancia para entender quiénes son y cómo han interactuado con otras personas a lo largo del tiempo. En esta investigación nos centramos en el estudio de la población prehispánica zapoteca en dos regiones del estado de Oaxaca: el valle central y la Sierra Norte. El objetivo fue identificar la población zapoteca prehispánica de estas dos regiones a partir de los datos genéticos derivados de restos óseos procedentes de excavaciones arqueológicas.